Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hpf1Q8CFE2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hpf1Q8CFE2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Hpf1Q8CFE2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Hpf1Q8CFE2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms