Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms