Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc38Q8CDN8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms