Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms