Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms