Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms