Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms