Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms