Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp43Q8BUM9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp43Q8BUM9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp43Q8BUM9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp43Q8BUM9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp43Q8BUM9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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