Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gga3Q8BMI3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms