Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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Nop53Q8BK35 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Nop53Q8BK35 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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