Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms