Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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Htatsf1Q8BGC0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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Htatsf1Q8BGC0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Htatsf1Q8BGC0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Htatsf1Q8BGC0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Htatsf1Q8BGC0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Htatsf1Q8BGC0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Htatsf1Q8BGC0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Htatsf1Q8BGC0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Htatsf1Q8BGC0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Htatsf1Q8BGC0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Htatsf1Q8BGC0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Htatsf1Q8BGC0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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