Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms