Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ttc28Q80XJ3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ttc28Q80XJ3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ttc28Q80XJ3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ttc28Q80XJ3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ttc28Q80XJ3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ttc28Q80XJ3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ttc28Q80XJ3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ttc28Q80XJ3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms