Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrrc1Q80VQ1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms