Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Clec4b1Q7TS58 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Clec4b1Q7TS58 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Clec4b1Q7TS58 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Clec4b1Q7TS58 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Clec4b1Q7TS58 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Clec4b1Q7TS58 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Clec4b1Q7TS58 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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