Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Actn1Q7TPR4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Actn1Q7TPR4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Actn1Q7TPR4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Actn1Q7TPR4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Actn1Q7TPR4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Actn1Q7TPR4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Actn1Q7TPR4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Actn1Q7TPR4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Actn1Q7TPR4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Actn1Q7TPR4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Actn1Q7TPR4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Actn1Q7TPR4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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