Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf139Q7TMV1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms