Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms