Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnih3Q6ZWS4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cnih3Q6ZWS4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms