Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms