Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms