Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms