Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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