Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Krt39Q6IFX4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Krt39Q6IFX4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Krt39Q6IFX4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Krt39Q6IFX4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Krt39Q6IFX4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Krt39Q6IFX4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Krt39Q6IFX4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Krt39Q6IFX4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Krt39Q6IFX4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Krt39Q6IFX4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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