Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TroQ6DIC6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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