Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc3Q64519 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms