Protein–RNA interactions for Protein: Q64364

Cdkn2a, Tumor suppressor ARF, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2aQ64364 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdkn2aQ64364 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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