Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim24Q64127 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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