Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms