Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms