Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ift52Q62559 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms