Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Sall3Q62255 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Sall3Q62255 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms