Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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