Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Cln3Q61124 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Cln3Q61124 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Cln3Q61124 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Cln3Q61124 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cln3Q61124 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms