Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms