Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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JrkQ60976 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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JrkQ60976 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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JrkQ60976 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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JrkQ60976 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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JrkQ60976 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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JrkQ60976 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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JrkQ60976 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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JrkQ60976 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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JrkQ60976 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
JrkQ60976 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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JrkQ60976 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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JrkQ60976 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms