Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms