Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms