Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms