Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
R3hdm4Q4VBF2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms