Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms