Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms