Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms