Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Capn13Q3UW68 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms