Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms