Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms