Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms