Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Nkx6-3Q3UHX8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Nkx6-3Q3UHX8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Nkx6-3Q3UHX8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms